מעבר בעלי חיים: עלה חדש, מכר שני מיליון עותקים בחודשיים הראשונים ליציאתו, מה שהופך אותו לכותר ה-Nintendo 3DS הראשון שסצח את רף שני מיליון, כך מדווח מגזין תעשיית המשחקים היפני Famitsu באמצעותמחסנית זעירה.
המשחק מכר 2.1 מיליון יחידות, מה שמציב אותו לפני כותרי 3DS אחרים כמוSuper Mario 3D Land, Mario Kart 7, Monster Hunter 3G, וSuper Mario Bros. 2 החדש. המכירות עבורמעבר בעלי חיים: עלה חדשגם להאפיל על אלו של משחק הפלייסטיישן 3 הנמכר ביותר -Final Fantasy 13, שמכר 1.9 מיליון עותקים ביפן.
מעבר בעלי חיים: עלה חדשעדיין נמצא מאחורי המשחק הנמכר ביותר ב-Nintendo Wii -Super Mario Bros. Wii החדש, שמכר 4.4 מיליון עותקים ביפן.
